Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYFIP1Q7L576 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms