Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms