Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC55Q6ZSA7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC55Q6ZSA7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC55Q6ZSA7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC55Q6ZSA7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC55Q6ZSA7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC55Q6ZSA7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC55Q6ZSA7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC55Q6ZSA7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC55Q6ZSA7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC55Q6ZSA7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC55Q6ZSA7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC55Q6ZSA7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC55Q6ZSA7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC55Q6ZSA7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC55Q6ZSA7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC55Q6ZSA7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC55Q6ZSA7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC55Q6ZSA7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC55Q6ZSA7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC55Q6ZSA7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC55Q6ZSA7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC55Q6ZSA7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC55Q6ZSA7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms