Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms