Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPOCD1Q6ZMY3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPOCD1Q6ZMY3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPOCD1Q6ZMY3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPOCD1Q6ZMY3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPOCD1Q6ZMY3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPOCD1Q6ZMY3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPOCD1Q6ZMY3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SPOCD1Q6ZMY3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPOCD1Q6ZMY3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPOCD1Q6ZMY3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPOCD1Q6ZMY3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPOCD1Q6ZMY3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPOCD1Q6ZMY3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPOCD1Q6ZMY3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPOCD1Q6ZMY3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPOCD1Q6ZMY3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPOCD1Q6ZMY3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPOCD1Q6ZMY3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPOCD1Q6ZMY3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPOCD1Q6ZMY3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms