Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFWD3Q6PCD5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFWD3Q6PCD5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFWD3Q6PCD5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFWD3Q6PCD5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFWD3Q6PCD5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFWD3Q6PCD5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFWD3Q6PCD5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RFWD3Q6PCD5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFWD3Q6PCD5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFWD3Q6PCD5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFWD3Q6PCD5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms