Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CSAG1Q6PB30 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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