Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K2

PMF1, Polyamine-modulated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1Q6P1K2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMF1Q6P1K2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMF1Q6P1K2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMF1Q6P1K2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PMF1Q6P1K2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PMF1Q6P1K2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PMF1Q6P1K2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PMF1Q6P1K2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMF1Q6P1K2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMF1Q6P1K2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMF1Q6P1K2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMF1Q6P1K2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMF1Q6P1K2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMF1Q6P1K2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMF1Q6P1K2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMF1Q6P1K2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMF1Q6P1K2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMF1Q6P1K2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMF1Q6P1K2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMF1Q6P1K2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMF1Q6P1K2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMF1Q6P1K2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PMF1Q6P1K2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMF1Q6P1K2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PMF1Q6P1K2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMF1Q6P1K2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMF1Q6P1K2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMF1Q6P1K2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMF1Q6P1K2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms