Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ETFRF1Q6IPR1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFRF1Q6IPR1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFRF1Q6IPR1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFRF1Q6IPR1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFRF1Q6IPR1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFRF1Q6IPR1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFRF1Q6IPR1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFRF1Q6IPR1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFRF1Q6IPR1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFRF1Q6IPR1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFRF1Q6IPR1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFRF1Q6IPR1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFRF1Q6IPR1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms