Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPRIN2Q6IMN6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPRIN2Q6IMN6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms