Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCTP1Q6DN14 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms