Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TXNDC8Q6A555 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC8Q6A555 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms