Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUPD1Q68J44 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms