Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms