Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms