Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms