Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BROXQ5VW32 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms