Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms