Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HES3Q5TGS1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms