Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD5Q5TGI4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD5Q5TGI4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD5Q5TGI4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD5Q5TGI4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD5Q5TGI4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD5Q5TGI4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD5Q5TGI4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD5Q5TGI4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD5Q5TGI4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD5Q5TGI4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD5Q5TGI4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD5Q5TGI4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD5Q5TGI4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD5Q5TGI4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD5Q5TGI4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD5Q5TGI4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD5Q5TGI4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD5Q5TGI4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD5Q5TGI4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD5Q5TGI4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD5Q5TGI4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD5Q5TGI4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SAMD5Q5TGI4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms