Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms