Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms