Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL7

PRAMEF14, PRAME family member 14, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF14Q5SWL7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms