Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPECC1Q5M775 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms