Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms