Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXA9

SIRPB2, Signal-regulatory protein beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPB2Q5JXA9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRPB2Q5JXA9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms