Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHC1Q5JVL4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms