Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms