Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms