Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC4Q5GLZ8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms