Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms