Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC178Q5BJE1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms