Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF6Q58WW2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF6Q58WW2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms