Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms