Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms