Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCM7

TUBB8, Tubulin beta-8 chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB8Q3ZCM7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB8Q3ZCM7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB8Q3ZCM7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms