Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms