Protein–RNA interactions for Protein: Q30154

HLA-DRB5, HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 5 chain, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRB5Q30154 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DRB5Q30154 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DRB5Q30154 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms