Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC27Q2M243 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms