Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MICAQ29983 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MICAQ29983 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MICAQ29983 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MICAQ29983 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MICAQ29983 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MICAQ29983 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MICAQ29983 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MICAQ29983 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MICAQ29983 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MICAQ29983 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MICAQ29983 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MICAQ29983 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MICAQ29983 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MICAQ29983 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MICAQ29983 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MICAQ29983 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MICAQ29983 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MICAQ29983 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MICAQ29983 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MICAQ29983 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MICAQ29983 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MICAQ29983 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MICAQ29983 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MICAQ29983 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MICAQ29983 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MICAQ29983 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MICAQ29983 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MICAQ29983 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MICAQ29983 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MICAQ29983 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MICAQ29983 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MICAQ29983 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MICAQ29983 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MICAQ29983 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MICAQ29983 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MICAQ29983 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MICAQ29983 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MICAQ29983 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MICAQ29983 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MICAQ29983 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MICAQ29983 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MICAQ29983 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MICAQ29983 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MICAQ29983 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MICAQ29983 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MICAQ29983 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MICAQ29983 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MICAQ29983 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MICAQ29983 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MICAQ29983 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MICAQ29983 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MICAQ29983 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MICAQ29983 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MICAQ29983 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MICAQ29983 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MICAQ29983 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MICAQ29983 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MICAQ29983 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MICAQ29983 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MICAQ29983 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MICAQ29983 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MICAQ29983 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MICAQ29983 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MICAQ29983 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MICAQ29983 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MICAQ29983 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MICAQ29983 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MICAQ29983 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MICAQ29983 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MICAQ29983 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MICAQ29983 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MICAQ29983 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MICAQ29983 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MICAQ29983 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MICAQ29983 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MICAQ29983 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MICAQ29983 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MICAQ29983 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MICAQ29983 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MICAQ29983 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MICAQ29983 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MICAQ29983 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MICAQ29983 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MICAQ29983 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MICAQ29983 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MICAQ29983 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MICAQ29983 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MICAQ29983 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MICAQ29983 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MICAQ29983 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MICAQ29983 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MICAQ29983 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MICAQ29983 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MICAQ29983 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MICAQ29983 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MICAQ29983 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MICAQ29983 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MICAQ29983 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MICAQ29983 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms