Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MICBQ29980 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MICBQ29980 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MICBQ29980 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MICBQ29980 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MICBQ29980 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MICBQ29980 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MICBQ29980 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MICBQ29980 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MICBQ29980 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MICBQ29980 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MICBQ29980 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MICBQ29980 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MICBQ29980 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MICBQ29980 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MICBQ29980 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MICBQ29980 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MICBQ29980 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MICBQ29980 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MICBQ29980 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MICBQ29980 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MICBQ29980 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MICBQ29980 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MICBQ29980 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MICBQ29980 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MICBQ29980 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MICBQ29980 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MICBQ29980 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MICBQ29980 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MICBQ29980 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MICBQ29980 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MICBQ29980 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MICBQ29980 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MICBQ29980 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MICBQ29980 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MICBQ29980 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MICBQ29980 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MICBQ29980 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MICBQ29980 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MICBQ29980 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MICBQ29980 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MICBQ29980 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MICBQ29980 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MICBQ29980 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MICBQ29980 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MICBQ29980 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MICBQ29980 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MICBQ29980 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICBQ29980 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICBQ29980 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICBQ29980 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICBQ29980 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MICBQ29980 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICBQ29980 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICBQ29980 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICBQ29980 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICBQ29980 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICBQ29980 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICBQ29980 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICBQ29980 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICBQ29980 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICBQ29980 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICBQ29980 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICBQ29980 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICBQ29980 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICBQ29980 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICBQ29980 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICBQ29980 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MICBQ29980 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICBQ29980 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICBQ29980 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MICBQ29980 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICBQ29980 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICBQ29980 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICBQ29980 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICBQ29980 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICBQ29980 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms