Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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LONRF1Q17RB8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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LONRF1Q17RB8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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LONRF1Q17RB8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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LONRF1Q17RB8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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LONRF1Q17RB8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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