Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UPP1Q16831 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms