Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF9Q16594 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF9Q16594 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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