Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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KCNMB1Q16558 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMB1Q16558 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMB1Q16558 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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