Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIK5Q16478 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIK5Q16478 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIK5Q16478 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIK5Q16478 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIK5Q16478 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIK5Q16478 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIK5Q16478 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIK5Q16478 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIK5Q16478 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIK5Q16478 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
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