Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZFHX3Q15911 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZFHX3Q15911 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZFHX3Q15911 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ZFHX3Q15911 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZFHX3Q15911 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZFHX3Q15911 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZFHX3Q15911 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZFHX3Q15911 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZFHX3Q15911 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZFHX3Q15911 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZFHX3Q15911 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZFHX3Q15911 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZFHX3Q15911 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZFHX3Q15911 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZFHX3Q15911 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZFHX3Q15911 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZFHX3Q15911 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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