Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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