Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHHQ15465 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHHQ15465 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHHQ15465 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SHHQ15465 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHHQ15465 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHHQ15465 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHHQ15465 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHHQ15465 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SHHQ15465 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHHQ15465 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHHQ15465 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHHQ15465 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHHQ15465 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHHQ15465 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SHHQ15465 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHHQ15465 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHHQ15465 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHHQ15465 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHHQ15465 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHHQ15465 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHHQ15465 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHHQ15465 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHHQ15465 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHHQ15465 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHHQ15465 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHHQ15465 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHHQ15465 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHHQ15465 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHHQ15465 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHHQ15465 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHHQ15465 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHHQ15465 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHHQ15465 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHHQ15465 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHHQ15465 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHHQ15465 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHHQ15465 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHHQ15465 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHHQ15465 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHHQ15465 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHHQ15465 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHHQ15465 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SHHQ15465 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SHHQ15465 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SHHQ15465 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHHQ15465 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHHQ15465 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHHQ15465 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHHQ15465 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHHQ15465 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHHQ15465 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHHQ15465 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHHQ15465 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHHQ15465 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHHQ15465 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHHQ15465 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHHQ15465 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SHHQ15465 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHHQ15465 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHHQ15465 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHHQ15465 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHHQ15465 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHHQ15465 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHHQ15465 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHHQ15465 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHHQ15465 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHHQ15465 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHHQ15465 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHHQ15465 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHHQ15465 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHHQ15465 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHHQ15465 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHHQ15465 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHHQ15465 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHHQ15465 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHHQ15465 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHHQ15465 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHHQ15465 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHHQ15465 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHHQ15465 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHHQ15465 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHHQ15465 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHHQ15465 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHHQ15465 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHHQ15465 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHHQ15465 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHHQ15465 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHHQ15465 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SHHQ15465 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHHQ15465 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHHQ15465 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHHQ15465 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHHQ15465 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHHQ15465 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHHQ15465 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHHQ15465 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHHQ15465 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHHQ15465 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHHQ15465 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
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