Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBE3CQ15386 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBE3CQ15386 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
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